Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms