Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms