Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABP4P57796 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABP4P57796 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP4P57796 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP4P57796 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP4P57796 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CABP4P57796 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP4P57796 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms