Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3AP57075 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms