Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms