Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMP1P54849 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EMP1P54849 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMP1P54849 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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EMP1P54849 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMP1P54849 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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EMP1P54849 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMP1P54849 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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