Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARSP54136 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARSP54136 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARSP54136 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARSP54136 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARSP54136 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARSP54136 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARSP54136 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARSP54136 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARSP54136 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms