Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LBX1P52954 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LBX1P52954 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LBX1P52954 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LBX1P52954 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LBX1P52954 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LBX1P52954 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LBX1P52954 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LBX1P52954 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LBX1P52954 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms