Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR5P51681 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR5P51681 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR5P51681 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR5P51681 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR5P51681 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR5P51681 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR5P51681 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR5P51681 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR5P51681 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR5P51681 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR5P51681 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms