Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DAP3P51398 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DAP3P51398 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DAP3P51398 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms