Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNN1GP51170 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCNN1GP51170 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms