Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP153P49790 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUP153P49790 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUP153P49790 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUP153P49790 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUP153P49790 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUP153P49790 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUP153P49790 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP153P49790 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP153P49790 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP153P49790 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP153P49790 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP153P49790 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP153P49790 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP153P49790 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP153P49790 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP153P49790 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP153P49790 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP153P49790 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP153P49790 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP153P49790 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP153P49790 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms