Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSEN1P49768 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms