Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP4P49662 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP4P49662 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP4P49662 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP4P49662 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP4P49662 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP4P49662 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP4P49662 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms