Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRP9P49458 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRP9P49458 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRP9P49458 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRP9P49458 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRP9P49458 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms