Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTAP49354 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTAP49354 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTAP49354 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms