Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIP4K2AP48426 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIP4K2AP48426 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms