Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN1S1P47710 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN1S1P47710 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms