Protein–RNA interactions for Protein: P46109

CRKL, Crk-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKLP46109 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRKLP46109 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRKLP46109 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRKLP46109 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRKLP46109 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRKLP46109 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRKLP46109 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRKLP46109 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRKLP46109 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRKLP46109 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRKLP46109 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRKLP46109 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRKLP46109 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms