Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPD2P43304 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPD2P43304 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD2P43304 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD2P43304 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD2P43304 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD2P43304 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms