Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3CAP42336 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3CAP42336 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms