Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP8P40818 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP8P40818 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP8P40818 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP8P40818 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP8P40818 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms