Protein–RNA interactions for Protein: P39925

AFG3, Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein AFG3, yeastyeast

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFG3P39925 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.59□□□□□ -1.99
AFG3P39925 BI2Q0110 1272 nt2.59□□□□□ -1.99
AFG3P39925 VAR1Q0140 1197 nt2.59□□□□□ -1.99
AFG3P39925 BIG1YHR101C 1008 nt2.59□□□□□ -1.99
AFG3P39925 RNP1YLL046C 750 nt2.59□□□□□ -1.99
AFG3P39925 YLR171WYLR171W 390 nt2.59□□□□□ -1.99
AFG3P39925 GCV2YMR189W 3105 nt2.59□□□□□ -2
AFG3P39925 KIN82YCR091W 2163 nt2.59□□□□□ -2
AFG3P39925 GPI17YDR434W 1605 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 UBP15YMR304W 3693 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 UTP13YLR222C 2454 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 GPI8YDR331W 1236 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 YIL058WYIL058W 285 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 MRPL33YMR286W 261 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 GPI15YNL038W 690 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 IRC16YPR038W 360 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.58□□□□□ -2
AFG3P39925 SRB8YCR081W 4284 nt2.57□□□□□ -2
AFG3P39925 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.57□□□□□ -2
AFG3P39925 RPL14BYHL001W 417 nt2.57□□□□□ -2
AFG3P39925 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.57□□□□□ -2
AFG3P39925 RUF22RUF22 515 nt2.57□□□□□ -2
AFG3P39925 BNR1YIL159W 4128 nt2.57□□□□□ -2
AFG3P39925 KAP123YER110C 3342 nt2.57□□□□□ -2
AFG3P39925 NDD1YOR372C 1665 nt2.57□□□□□ -2
AFG3P39925 ASG1YIL130W 2895 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 SSE1YPL106C 2082 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 INP53YOR109W 3324 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 RVS161YCR009C 798 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 YLR458WYLR458W 381 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 URA10YMR271C 684 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 YPL205CYPL205C 345 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 ROY1YMR258C 1662 nt2.56□□□□□ -2
AFG3P39925 TRA1YHR099W 11235 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 PFF1YBR074W 2931 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 YFL019CYFL019C 354 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 ANS1YHR126C 480 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 RPL40AYIL148W 387 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 HYR1YIR037W 492 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 YJL202CYJL202C 348 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 RPL36AYMR194W 303 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 YOR055WYOR055W 435 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 TRM7YBR061C 933 nt2.55□□□□□ -2
AFG3P39925 ECM5YMR176W 4236 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 MRD1YPR112C 2664 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 IRC4YDR540C 540 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 RTS3YGR161C 792 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 CRS5YOR031W 210 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 HRD3YLR207W 2502 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 PDR11YIL013C 4236 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 MMS1YPR164W 4224 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 RLI1YDR091C 1827 nt2.54□□□□□ -2
AFG3P39925 ISW1YBR245C 3390 nt2.53□□□□□ -2
AFG3P39925 YPL197CYPL197C 414 nt2.53□□□□□ -2
AFG3P39925 RPB5YBR154C 648 nt2.53□□□□□ -2
AFG3P39925 PRP6YBR055C 2700 nt2.53□□□□□ -2
AFG3P39925 KIP1YBL063W 3336 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 TOP2YNL088W 4287 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YDR209CYDR209C 414 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 BRP1YGL007W 378 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YPS5YGL259W 498 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YJR079WYJR079W 330 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 VPH2YKL119C 648 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YNL324WYNL324W 396 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YBR197CYBR197C 654 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 NUP170YBL079W 4509 nt2.52□□□□□ -2.01
AFG3P39925 BRO1YPL084W 2535 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 INP51YIL002C 2841 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 SWR1YDR334W 4545 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 PRK1YIL095W 2433 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YGL165CYGL165C 579 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YML108WYML108W 318 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 PKR1YMR123W 369 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YOR105WYOR105W 327 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 LCL1YPL056C 306 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 TOR1YJR066W 7413 nt2.51□□□□□ -2.01
AFG3P39925 FLO11YIR019C 4104 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 MUD2YKL074C 1584 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YBT1YLL048C 4986 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 RPI1YIL119C 1224 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 RPS1AYLR441C 768 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YPR177CYPR177C 372 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 MGR1YCL044C 1254 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 CYR1YJL005W 6081 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 SRO77YBL106C 3033 nt2.5□□□□□ -2.01
AFG3P39925 RTT10YPL183C 3042 nt2.49□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YKL063CYKL063C 504 nt2.49□□□□□ -2.01
AFG3P39925 YKL202WYKL202W 582 nt2.49□□□□□ -2.01
AFG3P39925 SPC29YPL124W 762 nt2.49□□□□□ -2.01
AFG3P39925 snR54snR54 86 nt2.49□□□□□ -2.01
AFG3P39925 SIR4YDR227W 4077 nt2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.1 ms