Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GGCXP38435 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GGCXP38435 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms