Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE6BP35913 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE6BP35913 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms