Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC1P33527 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCC1P33527 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms