Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTX2P32243 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTX2P32243 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTX2P32243 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTX2P32243 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTX2P32243 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTX2P32243 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTX2P32243 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms