Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXC13P31276 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms