Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA9P31269 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms