Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF1P30408 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms