Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5DP30049 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5DP30049 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms