Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
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