Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP1P28562 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms