Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMBRP28336 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMBRP28336 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMBRP28336 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMBRP28336 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NMBRP28336 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms