Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTAFRP25105 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms