Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GCSHP23434 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GCSHP23434 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSHP23434 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSHP23434 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms