Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL17P18621 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL17P18621 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL17P18621 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL17P18621 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL17P18621 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL17P18621 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL17P18621 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL17P18621 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL17P18621 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms