Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DESP17661 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DESP17661 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DESP17661 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DESP17661 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DESP17661 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DESP17661 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DESP17661 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DESP17661 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DESP17661 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms