Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms