Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms