Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 PEP8YJL053W 1140 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 EMC6YLL014W 327 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 FPR1YNL135C 345 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YOR055WYOR055W 435 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YBR209WYBR209W 318 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YDR186CYDR186C 2634 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 TPS2YDR074W 2691 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 DPB11YJL090C 2295 nt2.14□□□□□ -2.07
MSI1P13712 VPS41YDR080W 2979 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 SIR3YLR442C 2937 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YEL057CYEL057C 702 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 BI2Q0110 1272 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YGL165CYGL165C 579 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YJR023CYJR023C 402 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YLR171WYLR171W 390 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 NOP15YNL110C 663 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RPL25YOL127W 429 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YOR050CYOR050C 348 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 TRM7YBR061C 933 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 GCD10YNL062C 1437 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 GIN4YDR507C 3429 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 ARP8YOR141C 2646 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 PTP3YER075C 2787 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 PDR1YGL013C 3207 nt2.13□□□□□ -2.07
MSI1P13712 PSK2YOL045W 3306 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 NDD1YOR372C 1665 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 LEU3YLR451W 2661 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 SPE1YKL184W 1401 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 SMB1YER029C 591 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YPS5YGL259W 498 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 LAG1YHL003C 1236 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RPI1YIL119C 1224 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RPL36AYMR194W 303 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YPR177CYPR177C 372 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 snR41snR41 95 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YKR078WYKR078W 1758 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 GCV2YMR189W 3105 nt2.12□□□□□ -2.07
MSI1P13712 ORC2YBR060C 1863 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 PSO2YMR137C 1986 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 TPM2YIL138C 486 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 BET3YKR068C 582 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 AIM29YKR074W 468 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RPS7BYNL096C 573 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YPL197CYPL197C 414 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RPB5YBR154C 648 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 ROY1YMR258C 1662 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 SSE1YPL106C 2082 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 PDR11YIL013C 4236 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 IRA2YOL081W 9240 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 TRS130YMR218C 3309 nt2.11□□□□□ -2.07
MSI1P13712 MUD2YKL074C 1584 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 CSF1YLR087C 8877 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 BIG1YHR101C 1008 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YIL058WYIL058W 285 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 HYR1YIR037W 492 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YJR079WYJR079W 330 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 CMS1YLR003C 876 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RPL37AYLR185W 267 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 URA10YMR271C 684 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RPB11YOL005C 363 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 COQ10YOL008W 624 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YOL134CYOL134C 390 nt2.1□□□□□ -2.07
MSI1P13712 MDM32YOR147W 1869 nt2.09□□□□□ -2.07
MSI1P13712 ASG1YIL130W 2895 nt2.09□□□□□ -2.07
MSI1P13712 RMP1YLR145W 606 nt2.09□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.09□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YML108WYML108W 318 nt2.09□□□□□ -2.07
MSI1P13712 ATP15YPL271W 189 nt2.09□□□□□ -2.07
MSI1P13712 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.09□□□□□ -2.07
MSI1P13712 FAR11YNL127W 2862 nt2.09□□□□□ -2.08
MSI1P13712 ECM25YJL201W 1800 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 GPI8YDR331W 1236 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YFL019CYFL019C 354 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YGR042WYGR042W 816 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 VPH2YKL119C 648 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YKL202WYKL202W 582 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 TMA10YLR327C 261 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 RRT1YBL048W 312 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YBR197CYBR197C 654 nt2.08□□□□□ -2.08
MSI1P13712 GDS1YOR355W 1569 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 VTC3YPL019C 2508 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 ECL1YGR146C 636 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 TIM8YJR135W-A 264 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 RPS29AYLR388W 171 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 KTI11YBL071W-A 249 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 DGK1YOR311C 873 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 ATP3YBR039W 936 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 STE11YLR362W 2154 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 SPF1YEL031W 3648 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 KRE33YNL132W 3171 nt2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms