Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKBP12277 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKBP12277 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKBP12277 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKBP12277 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKBP12277 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKBP12277 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms