Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL11A1P12107 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL11A1P12107 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms