Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP2C9P11712 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms