Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACAA1P09110 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACAA1P09110 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms