Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAP2AP05549 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms