Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPN1P04843 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPN1P04843 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPN1P04843 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPN1P04843 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPN1P04843 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPN1P04843 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPN1P04843 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPN1P04843 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPN1P04843 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms