Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF2P04141 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF2P04141 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF2P04141 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSF2P04141 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF2P04141 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF2P04141 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF2P04141 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms