Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTNP04004 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTNP04004 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTNP04004 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTNP04004 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VTNP04004 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTNP04004 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms