Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOC3P02656 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOC3P02656 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOC3P02656 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms